Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms