Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms