Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms