Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREMQ03060 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CREMQ03060 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CREMQ03060 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CREMQ03060 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms