Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLOD1Q02809 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms