Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms