Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms