Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN7AQ01118 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms