Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms