Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms