Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms