Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN15P56746 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN15P56746 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms