Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAV3P56539 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAV3P56539 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAV3P56539 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms