Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBX2P52951 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBX2P52951 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBX2P52951 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms