Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms