Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX1P48742 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX1P48742 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX1P48742 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX1P48742 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX1P48742 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX1P48742 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms