Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GNPDA1P46926 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms