Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRPPRCP42704 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms