Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms