Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms