Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms