Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms