Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MATN1P21941 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MATN1P21941 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MATN1P21941 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms