Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCLP19338 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCLP19338 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCLP19338 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCLP19338 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCLP19338 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms