Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms