Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMC1P11047 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms