Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA8P0DM63 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms