Protein–RNA interactions for Protein: P0C6C1

ANKRD34C, Ankyrin repeat domain-containing protein 34C, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD34CP0C6C1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD34CP0C6C1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD34CP0C6C1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms