Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOP08100 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHOP08100 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms