Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGAVP06756 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms