Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK1P06493 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK1P06493 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK1P06493 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK1P06493 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK1P06493 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms