Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OPN1SWP03999 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms