Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GMDSO60547 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GMDSO60547 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GMDSO60547 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GMDSO60547 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GMDSO60547 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GMDSO60547 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GMDSO60547 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GMDSO60547 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GMDSO60547 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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