Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC3O60481 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC3O60481 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC3O60481 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC3O60481 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC3O60481 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC3O60481 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC3O60481 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC3O60481 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC3O60481 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC3O60481 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms