Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms