Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms