Protein–RNA interactions for Protein: A8MPP1

DDX11L8, Putative ATP-dependent RNA helicase DDX11-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11L8A8MPP1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX11L8A8MPP1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX11L8A8MPP1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms