Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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