Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms