Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms