Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms