Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms