Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms