Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms