Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms