Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms