Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN11AQ9UI33 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms