Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH3Q9UHC1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms