Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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