Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms